Ich finde es vorsichtig gesagt schon sehr gewagt, den Wagen so überhaupt zu bewegen...
Stell erstmal die Zündung richtig ein, dann guck mal während der Fahrt auf die Lambdaanzeige (wenn noch keine drin ist bau eine ein), dann siehst Du tendenziell schonmal ob der Motor zu mager läuft. Was für eine Einspritzung/Software fährst Du denn? Sehe ich das richtig das der Motor überhaupt nicht abgestimmt ist?
Unterschiedlich können z.B. Geometrie und Anzahl der Schaufelräder sein. Das hängt ja auch wesentlich davon ab, für was für einen Motor der Lader ursprünglich war, ein 3,3L Porsche hat logischerweise einen ganz anderen Lader drauf als z.B. ein 2,2L RS2 obwohl beide Motoren eine ähnliche Motorleistung haben... Welcher Lader jetzt der beste ist lässt sich pauschal so nicht sagen, kommt auf den Einsatzzweck an. Ich denke, der RS2 Lader dürfte gehen, viele schwören auch auf den normalen S2-Lader... Die K26er Reihe wurde in so vielen Fahrzeugen verbaut, keine Ahnung welcher jetzt optimal ist. Die alten 26er von den 10V-Audis sind auf jeden Fall nicht optimal... Es gibt auch K26 Rennlader, die sind mit den normalen K26ern auch wieder nicht zu vergleichen, vom Innenleben her sind die locker auf K27 bis K28 Format, aber ich denke so einer kommt für Dich nicht unbedingt in Frage...
Alles klar... 
Das was an dem 16V verbaut ist ist so mehr oder weniger das "Standartprogramm für den kleinen Geldbeutel". Ist nicht negativ gemeint, aber alle verbauten Teile bekommt man mittlerweile fast hinterhergeworfen. Dieses Konzept hat sich in der Praxis ja auch bewährt, mitte der 80er war Hohenester einer der ersten der ein nahezu identisches Setup brachte. Nur hatte der damals (ich meine mit einem K26) gute 300PS angegeben. Viele hier aus dem Forum fahren diese Kombination ja auch, gerade weil sie sich recht gut bewährt hat, aber ich glaube nicht das hier noch jemand von 400PS mit den erwähnten Komponenten träumt...
Ansonsten: Fakten auf den Tisch und Einzelheiten, sonst können wir das hier gleich zu den vielen vielen anderen geäusserten Tuningphantasien in einen Träumer-Thread verschieben. Erzählt wird viel, bewiesen meist wenig...
Back to Topic:
Für den 1,8er Umbau würde ich auf keinen Fall einen K26 aus dem alten 10V-Turbo nehmen. Bei mehr als 300 angepeilten PS eher den RS2 Lader. Inwieweit der normale K24 taugt vermag ich nicht genau zu sagen, wie gesagt, bei den Audis ist bei ca. 270PS Schluss...
Am S2 schaffst Du mit dem K24 ca. 260-270 PS. Wenn Du den auf 300 pushen willst brauchst Du einen grösseren Lader oder Du drehst dem K24 relativ schnell den Hals um... Die Calibra-Düsen sind niemals für 400PS gut. Das ginge höchstens mit einer Zusatzeinspritzung im Ansaugtrakt, davon lese ich da allerdings nichts...
Wobei die Zuleitung noch wichtiger ist, wenn da zu wenig Öl durchkommt verreckt der Lader irgendwann einfach. Ist der Rücklauf zu klein sieht man das schon recht schnell... 
Ich würde 2mm Innendurchmesser nicht nehmen, wie gesagt, zwischen 4 und 6mm finde ich optimal. Es mag ja durchaus auch kleiner gehen, habe ich nicht probiert...
Kann ich nicht mehr genau sagen was mich die Leitung damals gekostet hat (ich baue an der Kiste auch schon ewig...). Sollte aber nicht die Welt kosten, such Dir halt einfach einen Hydraulikladen in Deiner Gegend, am besten einen kleinen Laden wo man mit den Leuten auch mal einen Kaffee trinken und quatschen kann... Sowas braucht man sowieso immer mal wieder, egal ob Leitungen zum Turbo, zum Ölkühler oder Benzinleitungen...
Ich habe mir meine Leitungen in der "Hydraulikbude meines Vertrauens" pressen lassen. Vorteil: Exakt die richtige Länge/Anschlüsse, besseres Material als Serie und sehr günstig...
2mm ist ein bisschen wenig, so 4-6mm sollten´s schon sein.
Meiner läuft auch endlich, zwar im Moment nur im Stand weil Kurbelgehäuseentlüftung und Schaltung noch nicht ganz fertig aber es wird langsam...
413a ist ein sogenanntes "Drop in" Kältemittel, das kann ohne Ölwechsel gefüllt werden. Bei einer normalen Umrüstung muss das Öl gewechselt werden, da sich das alte und das neue Öl aber nicht miteinander mischen lassen und man nie das komplette Öl aus dem Kreislauf bekommt würde ich auch nicht auf 134a umstellen sondern auf 413a.
Das desinfizieren sehe ich aber noch ein, das neu befüllen würde ich mir definitiv sparen bzw. nur, wenn die Anlage leicht undicht ist, sprich schon spürbar Kühlleistung verliert. Ansonsten kann die Klimaanlage durchaus das Autoleben lang mit der ursprünglichen Füllung betrieben werden.
Eine Manometerbrücke mit den entsprechenden Adaptern und Kältemittelschläuchen.
Einen Link habe ich allerdings nicht parat. Wenn Du Dich mit der Materie nicht auskennst macht´s auch keinen Sinn, lass das lieber von einem Fachmann machen.
Ein Turbomotor hat aber am Verdichteraustritt durchaus mal > 150°C, ob das die Kunststoffkästen auf die Dauer mitmachen ist m.E. fraglich. Dann auf Nummer sicher gehen und in einer Metallbude vernünftige Alukästen anschweissen lassen. Das kostet meist nicht viel und man Kann Anschlussdurchmesser und Position gleich nach eigenen Vorstellungen verlegen.
Überprüfen und füllen ist kein Problem, das nötige Werkzeug vorausgesetzt. Man kann Manometer anschliessen und Verdampfungs- und Verflüssigungsdruck messen. Verdampfen sollte eine 134a Klimaanlage bei ca. 3 bar, verflüssigen bei ca. 16 bar. Das ist auch nicht verboten, es tritt ja kein Kältemittel dabei aus. Ich fülle Klimaanlagen immer nach dem Druck und nicht nach der Füllmenge, das ist mindestens genauso gut.
Teilenummer kann ich Dir morgen auf Arbeit mal raussuchen, vom Prinzip hört sich das so an, als ob das genau so funktioniert wie mit dem 2er Teil. Also vom Tank zum Schwerkraftventil und vom Schwerkraftventil direkt auf den Stutzen der hinter der Tankklappe endet. geht also direkt dort ins freie.
Hört sich so an, als ob die 2er Entlüftung genauso funktioniert wie die von mir beschriebene 3er TDI-Lösung...
Was den Fehler angeht, ich bin mir ziemlich sicher, das fast alle etwas älteren Motorsteuerungen KEINEN Fehler schmeissen. Ich habe die G60 Digifant drauf, da gibt´s keine Probleme. Was die Steuersache angeht, in dem Fall sind es alles Originalteile, den will ich mal sehen der auf die Idee kommt da wäre gebastelt worden...
Ne, FSI steht schliesslich für geschichtete Verbrennung...
